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如今微生物多樣性研究熱度持續(xù)高漲，而從大型微生物組的研究分析來看，人類微生物組所占的百分比最大，人類以及為人類服務(wù)的實驗動物的微生物相關(guān)研究共占據(jù)了全部研究的66%。
目前擴增子測序在人類健康相關(guān)疾病微生物研究中使用越來越廣泛，但是大家苦于找尋自己所研究疾病的相關(guān)擴增子測序文章，下面我們就盤點一下使用擴增子測序技術(shù)對各種疾病進行微生物研究的典型案例！
消化道疾病
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英文題目
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期刊名稱
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影響因子
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發(fā)表時間
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實驗樣品
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測序策略
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The pervasive effects of an antibiotic on the human gut microbiota, as revealed by deep 16S rRNA sequencing
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PLoS Biology
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4.587
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2008
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個人在服用環(huán)丙沙星前后糞便樣本
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細菌16S rDNA V3，V6區(qū)測序
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Towards the Human Colorectal Cancer Microbiome
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Plos one
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3.057
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2011
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來自6個接受了切除手術(shù)的原發(fā)性結(jié)腸腺癌患者癌組織和和癌旁粘膜樣品
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細菌16S rDNA V1-V3區(qū)測序
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Structural segregation of gut microbiota between colorectal cancer patients and healthy volunteers
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The ISME Journa
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9.328
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2012
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46例結(jié)直腸癌患者和56例健康對照志愿者的糞便樣品
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細菌16S rDNA V3區(qū)測序
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Co-occurrence of driver and passenger bacteria in human colorectal cancer
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Gut Pathogens
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2.816
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2014
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正常腸道組織樣本（ｎ＝10），腺瘤性息肉組織樣本（ｎ＝10），腫瘤組織樣本（ｎ＝8）
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細菌16S rDNA V1-V2區(qū)測序
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Impacts of infection with different toxigenic Clostridium difficile strains on faecal microbiota in children
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Scientific Reports
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5.228
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2014
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28-48月大的14個 (CDAD A+B+)感染兒童，23個 (CDAD A–B+)感染兒童，43個健康兒童糞便
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細菌16S rDNA V1-V3區(qū)測序
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呼吸道疾病
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英文題目
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期刊名稱
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影響因子
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發(fā)表時間
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實驗樣品
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測序策略
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Insights into the respiratory tract microbiota of patients with cystic fibrosis during early Pseudomonas aeruginosa colonization
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Springer Plus
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0.982
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2015
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5個囊性纖維化患者16–39 個月的20個痰樣本
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細菌16S rDNA V3-V4區(qū)測序
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Composition and dynamics of the respiratory tract microbiome in intubated patients
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Microbiome
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9.0
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2016
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15個呼吸衰竭受試者的上呼吸道口咽和深部氣管分泌物樣本
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細菌16S rDNA V6區(qū)測序
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Dysbiosis of upper respiratory tract microbiota in elderly pneumonia patients
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The ISME Journa
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9.328
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2016
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100位年齡》60歲的老年肺炎患者，27位年齡18歲-60歲的青年肺炎患者；91位健康的老年人和187位健康的青年人的口咽樣本
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細菌16S rDNA V5-V7區(qū)測序
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生殖道疾病
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英文題目
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期刊名稱
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影響因子
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發(fā)表時間
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實驗樣品
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測序策略
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Temporal and spatial variation of the human microbiota during pregnancy
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PNAS
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9.423
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2015
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49名18歲及以上的孕婦每一周以及產(chǎn)后的陰道、大便、唾液和牙齒/牙齦樣本
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細菌16S rDNA擴增子測序
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Cervicovaginal Bacteria Are a Major Modulator of Host Inflammatory Responses in the Female Genital Tract
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Immunity
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24.082
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2015
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94個無癥狀婦女陰道陰道棉簽擦拭樣品
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細菌16S rDNA V4區(qū)擴增子測序
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Metabolicsignatures of bacterial vaginosis
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mBIO
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6.786
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2015
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40個健康女性和20個細菌性陰道炎患者的聚氨酯泡沫拭子、陰道灌洗液、子宮頸灌洗液
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細菌16S rDNA V3-V4區(qū)測序
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口腔疾病
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英文題目
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期刊名稱
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影響因子
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發(fā)表時間
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實驗樣品
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測序策略
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A Filifactor alocis-centered co-occurrence group associates with periodontitis across different oral habitats
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Scientific Reports
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5.228
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2015
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牙周炎患者和健康志愿者的唾液，牙齦上菌斑，牙齦下菌斑樣品
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細菌16S rDNA V3-V4區(qū)測序
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Prediction of Early Childhood Caries via Spatial-Temporal Variations of Oral Microbiota
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Cell Host & Microbe
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12.552
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2015
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未患齲齒兒童；患有輕微齲齒兒童；患有嚴重齲齒兒童的唾液和牙菌斑樣品
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細菌16S rDNA V1-V3區(qū)測序
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Cigarette smoking and the oral microbiome in a large study of American adults
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The ISME Journal
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9.328
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2016
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從未吸過煙的志愿者；有過吸煙史但已戒煙的志愿者；一直吸煙志愿者的口腔樣本
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細菌16S rDNA V3-V4區(qū)測序
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皮膚疾病
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英文題目
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期刊名稱
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影響因子
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發(fā)表時間
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實驗樣品
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測序策略
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Topographic persity of fungal and bacterial communities in human skin
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Nature
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38.138
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2013
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十位健康成年人身上收集的易發(fā)生真菌性皮膚病的十四個皮膚部位拭子樣本
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細菌16S rDNA V3-V4區(qū)測序；真菌18SrDNA V1-V6區(qū)擴增子測序，；真菌ITS1擴增子測序
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Intestinal microbiome analyses identify melanoma patients at risk for checkpoint-blockade-induced colitis
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Nature communications
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11.329
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2016
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34名患黑色素瘤并且接受依普利姆瑪治療的病人糞便樣本（24名沒有患腸炎；10名患腸炎組）
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細菌16S rDNA V4-V5區(qū)測序
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免疫性疾病
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英文題目
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期刊名稱
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影響因子
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發(fā)表時間
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實驗樣品
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測序策略
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Decreased Bacterial Diversity Characterizes the Altered Gut Microbiota in Patients With Psoriatic Arthritis, Resembling Dysbiosis in Inflammatory Bowel Disease
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Arthritis Rheumatol
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6.009
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2015
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17個銀屑病關(guān)節(jié)炎患者，15個牛皮癬患者，17個健康志愿者糞便樣品
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細菌16S rDNA V1-V2區(qū)測序；
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Intestinal Dysbiosis in Ankylosing Spondylitis
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Arthritis Rheumatol
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6.009
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2015
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9個強直性脊柱炎患者，9個健康對照的糞便樣品
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細菌16S rDNA V4區(qū)測序
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心腦血管疾病
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英文題目
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期刊名稱
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影響因子
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發(fā)表時間
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實驗樣品
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測序策略
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Human oral, gut, and plaque microbiota in patients with atherosclerosis
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PNAS
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9.423
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2015
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15個正常人和15個動脈粥樣硬化患者的動脈粥樣硬化斑塊，腸道，口腔樣本
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細菌16S rDNA V1-V2區(qū)測序
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Microbiota Dysbiosis Controls the Neuroinflammatory Response after Stroke
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The Journal of Neuroscience
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5.924
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2016
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誘導(dǎo)中風(fēng)小鼠和正常小鼠的糞便樣本
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細菌16S rDNA V1-V3區(qū)測序
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Commensal microbiota affects ischemic stroke outcome by regulating intestinal γδ T cells
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Nature medicine
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30.357
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2015
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利用抗生素清除腸道微生物后的小鼠和一組對照小鼠的糞便樣本，然后中風(fēng)誘導(dǎo)
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細菌16S rDNA V4-V5區(qū)測序
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神經(jīng)性疾病
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英文題目
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期刊名稱
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影響因子
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發(fā)表時間
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實驗樣品
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測序策略
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Reduced diversity and altered composition of the gut microbiome in individuals with myalgic encephalomyelitis/chronic fatigue syndrome
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Microbiome
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9.0
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2016
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48例肌痛性腦脊髓炎/慢性疲勞綜合征患者和39例對照受試者的糞便樣品
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細菌16S rDNA V4區(qū)測序
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Reduced incidence of Prevotella and other fermenters in intestinal microflora of autistic children
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Plos one
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3.057
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2013
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20名正常人和20個自閉癥兒童的糞便樣品
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細菌16S rDNA V2-V3區(qū)測序
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Fecal microbiota and metabolome of children with autism and pervasive developmental disorder not otherwise specified
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Plos one
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3.057
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2013
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10名廣泛性發(fā)展障礙兒童，10名自閉癥兒童和10名正常兒童糞便樣本
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細菌16S rDNA V1-V3區(qū)測序
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乳腺癌
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英文題目
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期刊名稱
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影響因子
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發(fā)表時間
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實驗樣品
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測序策略
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The Microbiome of Aseptically Collected Human Breast Tissue in Benign and Malignant Disease
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Scientific Reports
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5.228
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2016
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乳腺癌患者和良性腫瘤的乳腺組織，乳房皮膚組織，乳房皮膚和口腔黏膜樣品
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細菌16S rDNA V3-V5區(qū)測序
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The microbiota of breast tissue and its association with tumours
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Appl.Environ. Microbiol.
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3.823
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2016
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乳腺癌患者癌旁正常組織和健康對照組的組織
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細菌16S rDNA V6區(qū)測序
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代謝類疾病
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英文題目
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期刊名稱
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影響因子
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發(fā)表時間
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實驗樣品
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測序策略
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A core gut microbiome in obese and lean twins
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Nature
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38.138
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2009
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胖瘦不同的同卵雙胞胎（31對）、異卵雙胞胎（23對）及其母親（46個）的糞便樣本
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細菌16S rDNA V2,V6區(qū)測序
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Gut microbiota in human adults with type 2 diabetes differs from non-diabetic adults
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Plos one
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3.057
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2010
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Ⅱ型糖尿病男性患者18人，正常男性18人的糞便樣本
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細菌16S rDNA V4-V6區(qū)測序
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Fecal microbiota imbalance in Mexican children with type 1 diabetes
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Scientific Reports
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5.228
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2014
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8 例健康兒童，8 例初發(fā) I 型糖尿病患者，
以及 13 例已治療兩年的 I 型糖尿病患者的糞便樣本
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細菌16S rDNA V4區(qū)測序
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The stool microbiota of insulin resistant women with recent gestational diabetes, a high risk group for type 2 diabetes
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5.228
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2015
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分娩3-16個月后的42名妊娠期糖尿病患者和35名健康者糞便樣品
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細菌16S rDNA V4區(qū)測序
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相信看完這些文章集錦給各領(lǐng)域的您已經(jīng)帶來思路上的啟發(fā)，但是下一步的擴增子測序又怎么能缺少天昊生物呢，來看看我們擴增子測序絕對任性的服務(wù)吧！?。?/span>
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