多個SNP位點(3-8個)的分型項目,樣本量可以幾百個到上千個。
技術方法:
連接酶檢測反應 (ligase detection reaction,LDR)是利用高溫連接酶實現(xiàn)對基因多態(tài)性位點的識別。高溫連接酶一旦檢測到DNA與互補的兩條寡聚核苷酸接頭對應處存在著基因點突變類型的堿基錯配,則連接反應就不能進行。 如下左圖:右邊的探針與模板有一個堿基不配對,所以連接反應不能進行,沒有連接產(chǎn)物;左邊的探針與模板DNA完全互補,故進行連接反應。通過溫控循環(huán)該特異性連接反應可反復進行,達到線性擴增的效果。當檢測到DNA與互補的兩條寡聚核昔酸接頭對應處存在著堿基錯配,則連接反應就不能進行。在同時存在著熒光標記的探針時,由于前者與模板DNA互補,故它與下游探針的連接反應得以進行,而后者則無法與下游探針連接。在連接反應結束后進行測序儀檢測,檢測到的結果即為G,從而可認定該SNP位點為G。LDR檢測方法利用長度差異可以將多重LDR產(chǎn)物在ABI測序系統(tǒng)中進行檢測,實現(xiàn)一次檢測多個SNP位點。 ![]() 應用領域: 本方法適用于多個涉及到SNP分型的遺傳研究領域。
檢測對象:
基因組DNA 服務內(nèi)容:
檢測實例:
2個樣品的7個SNP位點分型圖 |