動(dòng)植物基因組重測(cè)序技術(shù)介紹
***************************************************************************************************** 技術(shù)簡(jiǎn)介: 全基因組重測(cè)序就是對(duì)基因組序列已知的物種或個(gè)體進(jìn)行基因組測(cè)序,從而對(duì)群體或者個(gè)體在全基因組水平進(jìn)行差異性分析,通過(guò)與參考基因組進(jìn)行比對(duì),發(fā)現(xiàn)大量的基因序列變異和結(jié)構(gòu)變異,例如單核苷酸多態(tài)性位點(diǎn)(SNP),插入缺失(InDel),拷貝數(shù)變異(CNV),結(jié)構(gòu)變異(SV)。因此動(dòng)植物基因組重測(cè)序在群體進(jìn)化,功能基因鑒定,分子標(biāo)記開(kāi)發(fā),動(dòng)植物育種,疾病研究等方面具有非常重要的指導(dǎo)意義。 應(yīng)用領(lǐng)域:
技術(shù)優(yōu)勢(shì):
技術(shù)參數(shù)與實(shí)驗(yàn)流程
***************************************************************************************************** 技術(shù)參數(shù)
A. 建庫(kù)測(cè)序流程 ![]()
B. 數(shù)據(jù)分析流程
經(jīng)典文章解讀 ![]()
圖一:62個(gè)棗椰樹(shù)品種單核苷酸多態(tài)性分析
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圖二:棗椰樹(shù)群體結(jié)構(gòu)分析。(A)主成分PCA分析。(B)Neighbour-joining tree(c)群體分層
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圖三:棗椰樹(shù)基因組中近親繁殖的證據(jù)
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